Avoin tiede

FinnGen on sitoutunut edistämään tutkimuksen aikana rakennettujen tieteellisesti arvokkaiden tietovarantojen avointa käyttöä. Seuraavassa osiossa esitellään useita toisiaan täydentäviä lähestymistapoja, joiden avulla tiedot, tulokset tai työkalut ovat laajasti saatavilla noudattaen samalla henkilötietojen jakamiseen liittyviä parhaita käytäntöjä ja säännöksiä.

Jotta hankkeen panos maailmanlaajuiseen biolääketieteelliseen tutkimukseen olisi mahdollisimman suuri, FinnGen GWAS -analyysien tulosaineisto julkaistaan koko tiedeyhteisön saataville vuoden viiveellä siitä, kun FinnGen-hankkeen tutkijat ovat saaneet aineiston käyttöönsä. Julkisia tietoja julkaistaan kaksi kertaa vuodessa, ja tuloksia voi joko selata interaktiivisten verkko-ohjelmien avulla (FinnGen PheWeb -selain) tai ladata ilmaiseksi. Toukokuuhun 2024 mennessä olemme saaneet yli 21 000 latauspyyntöä tutkijoilta eri puolilta maailmaa. Lisäksi kesäkuusta 2021 lähtien tulokset löytyvät myös  OpenTargets Platform and Genetics -portaalista. 

FinnGenin tuottama genomitieto palautetaan suomalaisiin biopankkeihin, ja tutkijat ympäri maailmaa voivat hakea sitä käyttöönsä jatkotutkimushankkeita varten. FinnGenin ansiosta suomalaisissa biopankeissa on yli puolen miljoonan suomalaisen genomitiedot. Tämä tarjoaa pohjan uusille akateemisille tutkimushankkeille, teollisuuden yhteistyökumppanuuksille, lääketutkimuksille, seurantatutkimuksille ja muille yksityisen ja julkisen sektorin hankkeille.

FinnGenin aikana on panostettu merkittävästi mielekkäiden kliinisten päätepisteiden luomiseen suomalaisten terveysrekisterien digitaalisten terveystietojen pohjalta. Nämä ovat julkisesti saatavilla, ja tutkimusyhteisö voi oppia lisää parhaista käytännöistä, jotka liittyvät tiettyjen sairauspäätepisteiden muodostamiseen Risteys-työkalun kautta tai vierailemalla Kliiniset päätepisteet -sivulla. FinnGen työskentelee myös suomalaisten ICD-koodien muuntamiseksi OMOP-CDM-standardin mukaiseen tietomalliin, jotta yhteensopivuus muiden maailmanlaajuisten biolääketieteellisten tutkimushankkeiden kanssa olisi mahdollisimman hyvä.

FinnGen on myös luonut ja kehittänyt laskennallisia analyysiprosesseja ja työkaluja, jotka soveltuvat suurten genomitietoainestojen tallentamiseen ja analysointiin. Nämä työkalut ovat laajalti tiedeyhteisön käytettävissä, ja tutkimuksen aikana hankittua tietoa jaetaan laajasti tiedeyhteisössä Suomessa, muissa Euroopan maissa ja maailmanlaajuisesti.