Öppen vetenskap

FinnGen är starkt engagerat i att främja den öppna användningen av den vetenskapligt värdefulla dataresursen som har byggts upp under studien. Nedan presenterar vi flera kompletterande metoder som möjliggör att antingen data, resultat eller verktyg görs allmänt tillgängliga samtidigt som vi följer bästa praxis och regler för delning av personuppgifter.

För att göra största möjliga bidrag till global biomedicinsk forskning, görs fullständiga resultat och sammanfattande statistik för FinnGens GWAS-analyser offentligt tillgängliga för hela vetenskapssamfundet efter ett embargo på ett år (https://www.finngen.fi/sv/access_results). Offentliga datapubliceringar görs två gånger om året, och resultaten kan antingen bläddras igenom med ett interaktivt webbverktyg (FinnGen PheWeb-webbläsare) eller laddas ner kostnadsfritt. Vid maj 2024, vi har fått över 21 000 nedladdningsförfrågningar från forskare runt hela världen. Dessutom har resultaten sedan juni 2021 också lagts till i den populära OpenTargets Platform och Genetic-portalen. 

Genomdatan som produceras i FinnGen returneras till finländska biobanker och forskare runt om i världen kan ansöka om åtkomst för ytterligare forskningsprojekt. Tack vare FinnGen, kommer finländska biobanker att innehålla genomdata från över en halv miljon finländare. Detta kommer att utgöra grunden för nya akademiska forskningsprojekt, industriella partnerskap, läkemedelsstudier, övervakningsstudier och andra privat-offentliga projekt. 

Under FinnGen har betydande insatser lagts ned på att skapa meningsfulla kliniska slutpunkter baserade på data från digitala hälsoregister i Finland. Dessa är offentligt tillgängliga och forskarsamhället kan lära sig mer om bästa praxis för att skapa specifika kliniska slutpunkter genom verktyget Risteys eller genom att besöka sidan för kliniska slutpunkter. FinnGen arbetar också med att omvandla finska ICD-koder till standardiserade OMOP-CDM-datamodellen, för att maximera interoperabiliteten med andra globala biomedicinska forskningsinsatser.  

Slutligen har FinnGen etablerat och utvecklat beräkningsanalysprocesser och verktyg lämpliga för lagring och analys av stora genomdata. Dessa verktyg är allmänt tillgängliga för den vetenskapliga gemenskapen, och den kunskap som förvärvats under studien delas brett inom den vetenskapliga gemenskapen i Finland, andra europeiska länder och globalt.(lisää linkki tools osioon)