Forskningsaktiviteter
FinnGen-konsortiet är engagerat i aktiv forskning
Utöver att samla in och producera data utför FinnGen även analyser för att upptäcka genetiska varianter som predisponerar för eller skyddar mot sjukdomar. I de första två faserna, FinnGen 1 och 2, var projektets mål att samla in, genotypa, imputera och analysera FinnGen-data. Resultaten av dessa kärnanalyser, producerade av FinnGen-teamen, inkluderar GWAS- och PheWas-resultat för tusentals sjukdomsslutpunkter (fenotyper), finmappning av GWAS-träffar, samlokalisering av GWAS-träffar och variantanteckningar.
I den nuvarande tredje fasen av FinnGen kommer den centrala FinnGen-analysprocessen att köras på alla relevanta kliniska laboratorievärden, och resultaten kommer att förses tillsammans med andra GWAS-sammanfattningsstatistik och inkluderas i PheWeb-resursen. Forskare från konsortiepartnerna använder aktivt data och resultat i sina studier av gener och sjukdomar som de är intresserade av.
FinnGen undersöker den biologiska betydelsen av finskt berikade varianter
FinnGen har upptäckt mer än 150 kodande varianter som är associerade med sjukdomar och som är specifikt berikade i den finländska populationen. Dessa varianter, som inkluderar både riskorsakande och skyddande varianter, kan hjälpa till att identifiera mål för läkemedelsutveckling. De biologiska konsekvenserna av dessa nya sjukdomsassocierade varianter kommer att undersökas med hjälp av proteomik, enkelkärnig RNA- och ATAC-sekvensering, högupplöst cellavbildning, immunoprofilering, kliniska laboratorievärden och data från elektroniska journaler.
FinnGens kärnanalyser
Läs mer om FinnGens kärnanalyser
FinnGen 3
Läs mer om FinnGen 3
Kohort och data
Läs mer om kohort och data
Publikationer
(opens a new tab)
Lista över FinnGen-publikationer
FinnGen fokuserar på utvalda vanliga sjukdomar
FinnGen har valt ca tio vanliga sjukdomar för longitudinella analyser. Målet är att förstå det genetiska bidraget till sjukdomsprogression och terapeutiskt svar genom att analysera sjukdomsförlopp och tillstånd före och efter diagnos. Forskningen om de valda sjukdomarna drivs av dedikerade arbetsgrupper som planerar analyserna som utnyttjar upp till 50 års longitudinella hälsodata, kliniska laboratoriedata och seriella, longitudinella prover, vilka kommer att profileras med omik för att upptäcka förändringar i biomarkörer. Baserat på dessa data kommer FinnGen att utveckla nya metoder för analysera progression.
FinnGen 2 utökades till sex pilotprojekt för att bredda projektets omfattning
Under FinnGen 2 ytterligare aktiviteter tillades i projektet genom att införa sex pilotprojekt, eller expansionsområden (EA), inklusive: Förbättra rekryteringen inom specifika kliniska områden (EA1), återkontakta deltagare med frågeformulär (EA2), Utöka mängden av kliniska data (EA3), Metaanalyser med andra befolkningsdata (EA4), Klinisk och molekylär karaktärisering av finska genvarianter (EA5) Identifiera tidiga kognitiva förändringar vid Alzheimers sjukdom (EA6).