Internationellt biobanksamarbete möjliggjorde resultaten av genforskning om en sällsynt lungsjukdom

I en forskning ledd av Helsingfors universitet hittades sju tidigare okända genetiska riskfaktorer för idiopatisk lungfibros, en sjukdom som tillhör gruppen sällsynta sjukdomar. Av dessa skulle endast en ha identifierats om endast europeiska biobanker hade utnyttjats i studien.

Forskningen möjliggjordes genom globalt samarbete, möjliggjorde för nästan 1,4 miljoner personer att delta i studien och representera sex olika ursprung från hela världen. Över 11 000 av dem led av lungfibros.

– De flesta av de riskgener vi identifierade är helt nya, och deras funktion i lungorna är okänd. En del verkar å andra sidan vara relaterade till lungfunktioner, som lungkapacitet eller slemproduktion, konstaterar doktoranden Juulia Partanen, som genomförde studien vid Helsingfors universitets Institutet för molekylärmedicin i Finland, FIMM. 

Internationellt samarbete är en förutsättning för forskning om sällsynta och svåra sjukdomar

Breda genstudier har visat sig vara ett effektivt sätt att generera ytterligare information om sjukdomars uppkomstmekanismer. Genom dem kan man identifiera genetiska riskfaktorer som påverkar sjukdomsbenägenheten och därigenom de biologiska vägarna som är relevanta för sjukdomen.

Utmaningen för genetiska analyser i fråga om sällsynta sjukdomar utgör den begränsade mängden tillgängliga patientprover för forskningen. För att få pålitliga resultat krävs vanligtvis omfattande data från tusentals eller till och med tiotusentals patienter, och därför behövs globalt samarbete. 

Idiopatisk lungfibros är en svår sjukdom som skadar lungvävnaden och för vilken det inte finns någon botande behandling. Sjukdomens orsak är okänd. Det gör genforskning om sjukdomen särskilt intressant, eftersom den kan belysa mekanismer och nya behandlingsmetoder som ligger bakom sjukdomen. 

I Finland uppskattas det finnas cirka 1000 patienter som lider av idiopatisk lungfibros. För att öka antalet patienter blev internationellt samarbete och kombineringen av forskningsmaterial från olika länder avgörande, både när det gäller materialets omfattning och den genetiska mångfalden hos studiedeltagarna. 

– Avgörande för forskningens framgång har varit de finländska lungläkarnas långsiktiga arbete för patienter med lungfibros och patienternas positiva inställning till biobanksforskning. Det har möjliggjort insamling av unikt kliniskt material och genomförande av biologisk forskning, berättar överläkare och professor i lungsjukdomar och allergologi, Marjukka Myllärniemi från HUS.

I den nyligen publicerade studien utnyttjade forskarna 13 olika biobanksstudier genomförda runt om i världen, inklusive den finländska FinnGen-studien. På detta sätt ökade antalet deltagande patienter i studien över fyra gånger jämfört med den studien som tidigare var störst. 

 – Genetisk forskning har tidigare varit starkt inriktad på den västerländska befolkningen. Den nyligen publicerade studien visar att en betydande del av sjukdomarnas genetiska riskfaktorer förblir oidentifierade om vi inte aktivt försöker förändra detta mönster. Det är också globalt rättvist att utvidga forskningen om sjukdomsorsaker till olika befolkningsgrupper. Sådant samarbete är möjligt endast genom öppen delning av information mellan forskare som är intresserade av ämnet, säger forskaren Jukka Koskela, klinisk forskare vid Finlands Akademi, från Helsingfors universitets Institutet för molekylärmedicin i Finland, FIMM.

En del av riskgenerna ökar också risken för allvarliga fall av covid-19

Studien bekräftade även tidigare observationer om samband mellan idiopatisk lungfibros och allvarlig form av Covid-19. Studien visade att sju genetiska riskfaktorer som ökar risken för lungfibros också påverkar risken att drabbas av allvarlig Covid-19-infektion.

– I återhämtningsfasen av lungfibros observeras delvis samma typ av lungskada som vid svår covid-19. Vi har funderat på om gemensamma genetiska områden har samband med denna specifika typ av lungskada eller om det är något annat som förenar sjukdomarna. Kanske kan man i framtiden påverka bildandet av skadan på något sätt, berättar Juulia Partanen.

Resultaten av studien publicerades nyligen i tidskriften Cell Genomics. Studien är en del av en större serie globala genetiska studier genomförd av forskarkonsortiet Global Biobank Meta-Analysis Initiative.

Ursprungliga publikationen:

Partanen J. et al. Leveraging global multi-ancestry meta-analysis in the study of Idiopathic Pulmonary Fibrosis genetics. Cell Genomics, Vo 2, Issue 10, 100181. DOI:https://doi.org/10.1016/j.xgen.2022.100181